我院是集醫療、教學、科研和預防保健為一體的大型三級甲等中醫院，是國家衛生計生委國際緊急救援中心網絡醫院、國家愛嬰醫院、國家藥物臨床試驗機構和省級重點中醫院建設單位。2012年醫院成為北京中醫藥大學非直屬附屬醫院，步入了新的發展階段。醫院現分江北南橋寺院部和渝中區道門口院部，占地163畝，建筑面積近11萬平方米，在建面積1.24萬平方米，三期工程規劃建筑面積5萬平方米。現編制床位1800張，臨床科室32個，醫技科室10個。年門診量130萬人次，年出院病人約4萬人次。有國家臨床重點專科5個（皮膚科、針灸科、腫瘤科、腎病科、護理學），國家中醫藥管理局重點建設學科1個（中醫皮膚學科）；國家中醫藥管理局重點專科及建設培育項目10個（皮膚科、針灸科、腫瘤科、腎病科、婦科、腦病科、肛腸科、骨傷科、肝病科、護理學）；國家中醫藥管理局重點研究室1個（濕疹中醫外治法重點研究室）、二級實驗室2個（生化實驗室、免疫微生物實驗室）；衛生部診斷鑒定機構1個（化妝品皮膚病鑒定機構）；重慶市市級臨床重點專科1個（麻醉科）；重慶市中醫重點學（專）科12個（皮膚科、針灸科、腫瘤科、腎病科、婦科、腦病科、肛腸科、骨傷科、肝病科、風濕病科、兒科、眼科），重慶市中西醫結合醫療中心3個（中西醫結合皮膚病防治中心、中西醫結合腦血管病康復治療中心、頸腰腿痛治療中心）；重慶市醫療質量控制中心2個（皮膚科醫療質量控制中心、美容皮膚科醫療質量控制中心）；院內研究所3個（皮膚病研究所、針灸研究所、古驗方與中藥制劑研究所）；是重慶市中醫特色診療工程技術中心、重慶市博士后科研工作站、重慶市中醫護理臨床技術指導中心。醫院設有中國中醫藥文獻檢索中心重慶分中心、全國針灸臨床中心重慶分中心，辦有《中國中醫急癥》雜志。重慶市中醫藥學會、重慶市中西醫結合學會、重慶市針灸學會和重慶市中醫藥行業協會均掛靠在醫院。